Clementia đã hạ sinh một đứa con trai, Jean, vào ngày 13 tháng 11 năm 1316, nhưng chết non 5 ngày sau đó[9] vì bệnh dịch. Chú của Jeanne, Eudes IV, Công tước xứ Bourgogne, người ở Paris, đã tham gia đàm phán với con trai thứ hai của Philippe IV, Philippe V, để bảo vệ lợi ích của Jeanne, nhưng Philippe không đáp ứng yêu cầu của Eudes[8]. Thay vào đó, ông đã bí mật sắp xếp cho lễ đăng quang của riêng mình, diễn ra tại Reims vào ngày 9 tháng 1 năm 1317[8][9]. Cùng năm 1317, một hội đồng của các lãnh chúa Pháp đã củng cố vị trí của Philippe vào ngày 2 tháng 2, tuyên bố rằng một người phụ nữ không thể thừa kế vương miện Pháp[10]. Các quý tộc người Navarra đã phái một phái đoàn đến Paris để thề trung thành với Philippe.[11] Philippe cũng từ chối đưa Champagne và Brie cho Jeanne.[12]

Bà ngoại của Jeanne, Agnes của Pháp, Nữ công tước xứ Bourgogne, đã gửi thư cho các lãnh chúa hàng đầu của Pháp, phản đối việc đăng quang của ông, nhưng Philippe V đã lên ngôi mà không có sự phản đối nào cả[9][10]. Những lá thư cũng được viết cho các lãnh chúa của Champagne dưới tên của Jeanne, kêu gọi họ kiềm chế không tỏ lòng trung thành với Philippe và để bảo vệ quyền của Jeanne đối với Champagne[13]. Trong một bức thư khác, Eudes IV lập luận rằng sự khinh miệt của Jeanne bởi Philippe V đã đi ngược lại "quyền thiêng liêng của pháp luật, theo thông lệ, trong cách sử dụng được giữ trong các trường hợp tương tự ở các đế chế, vương quốc, những kẻ đáng sợ, trong các thời kỳ như vậy không có ký ức ngược lại "[13]. Tuy nhiên, chú của Philippe V, Charles xứ Valois, đã đánh bại những người ủng hộ Jeanne.[9]

Philippe và Eudes đã ký kết một thỏa thuận vào ngày 27 tháng 3 năm 1318[9][13]. Philippe đã cho con gái lớn của mình (cũng được đặt tên là Jeanne) kết hôn với Eudes, công nhận họ là người thừa kế của các lãnh địa bá tước Bourgogne và Artois, trong khi Jeanne kết hôn với anh họ của bà, Philippe của Évreux, với của hồi môn 15.000 livres tournois trong tiền thuê nhà và quyền thừa kế Champagne và Brie nếu Philippe V băng hà mà không để lại con trai.[13] Một số người cũng đồng ý rằng Jeanne sẽ từ bỏ yêu sách của mình với Pháp và Navarra khi mới 12 tuổi[14]. Không có bằng chứng cho thấy việc từ bỏ từng diễn ra.[15] Hôn lễ của Jeanne và Philippe được tổ chức vào ngày 18 tháng 6 năm 1318[16]. Sau đó, Jeanne sống với bà của chồng cô, Marie xứ Brabant.[17] Mặc dù họ sống gần nhau, nhưng Philippe và Jeanne không được nuôi dưỡng cùng nhau do chênh lệch tuổi tác[18]. Cuộc hôn nhân chỉ được hoàn thành từ năm 1324.[19]